Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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SNCBQ16143 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCBQ16143 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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