Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USF2Q15853 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USF2Q15853 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USF2Q15853 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USF2Q15853 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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