Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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