Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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