Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERC3Q15034 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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