Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMCO1Q147U7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms