Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms