Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK13Q14004 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
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