Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms