Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CBFBQ13951 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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