Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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