Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TMED1Q13445 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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TMED1Q13445 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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