Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN4PQ13434 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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