Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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