Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PEMT-210ENST00000484838 803 ntTSL 218.89■□□□□ 0.619e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 UCK1-208ENST00000491309 2237 ntTSL 218.8■□□□□ 0.69e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.594e-24■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.599e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.529e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.529e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.519e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CLCN7-209ENST00000565092 2740 ntTSL 218.21■□□□□ 0.59e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 518.12■□□□□ 0.499e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.479e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PHKG2-207ENST00000564838 1618 ntTSL 217.9■□□□□ 0.469e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 GET4-203ENST00000412734 873 ntTSL 217.84■□□□□ 0.459e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 HSPG2-214ENST00000635682 921 ntTSL 517.71■□□□□ 0.439e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 GRINA-204ENST00000527194 806 ntTSL 217.7■□□□□ 0.422e-33■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.422e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.49e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CDC23-207ENST00000483961 549 ntTSL 417.52■□□□□ 0.49e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ENTPD6-218ENST00000490187 1918 ntTSL 217.5■□□□□ 0.399e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.389e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NFYC-218ENST00000488635 1481 ntTSL 1 (best)17.37■□□□□ 0.372e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.379e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.369e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.349e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 517.09■□□□□ 0.339e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 GTF3C1-211ENST00000569653 897 ntTSL 216.81■□□□□ 0.289e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CYHR1-208ENST00000528663 5821 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.279e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 BAG6-244ENST00000435080 1710 ntTSL 516.66■□□□□ 0.269e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ENTPD6-204ENST00000376666 2100 ntTSL 516.65■□□□□ 0.269e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ADCK1-207ENST00000556560 1046 ntTSL 516.59■□□□□ 0.259e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.249e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ENTPD6-217ENST00000485936 2588 ntTSL 216.51■□□□□ 0.239e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PEMT-209ENST00000477595 430 ntTSL 316.41■□□□□ 0.229e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.219e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.219e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.219e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.219e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TSEN54-203ENST00000545228 1139 ntTSL 516.31■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.169e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.152e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 AC084033.3-204ENST00000553102 705 ntTSL 215.92■□□□□ 0.149e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.139e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.129e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.129e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.074e-24■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.069e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.039e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.029e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TBC1D20-204ENST00000494633 3820 ntTSL 215.16■□□□□ 0.029e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PHKG2-206ENST00000563913 1791 ntTSL 515.03■□□□□ -09e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 BAG6-255ENST00000456622 859 ntTSL 515□□□□□ -0.019e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 GTF3C1-203ENST00000562609 2824 ntTSL 514.93□□□□□ -0.029e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.029e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.049e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ADCK1-204ENST00000555217 3560 ntTSL 214.79□□□□□ -0.049e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.049e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 BAG6-239ENST00000424176 747 ntTSL 314.73□□□□□ -0.059e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.069e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CLCN7-205ENST00000563642 4184 ntTSL 214.66□□□□□ -0.069e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CDC23-209ENST00000511383 584 ntTSL 314.65□□□□□ -0.069e-6■■■■□ 24.7
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PABPC4Q13310 PEMT-213ENST00000582268 383 ntTSL 214.27□□□□□ -0.139e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NCKAP5L-202ENST00000433948 4235 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.139e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TSEN54-204ENST00000577197 650 ntTSL 214.22□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.149e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ZNF274-201ENST00000326804 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-8■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.169e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.29e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 USP3-203ENST00000538686 2077 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.219e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 BTBD10-201ENST00000278174 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.279e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.279e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PER1-214ENST00000582719 3677 ntTSL 513.33□□□□□ -0.289e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 BEX5-203ENST00000543160 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.299e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.312e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 AC013248.2-201ENST00000412454 459 ntBASIC13.01□□□□□ -0.339e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TWNK-201ENST00000311916 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.349e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 BTBD10-206ENST00000527102 2338 ntTSL 212.9□□□□□ -0.349e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TMEM69-201ENST00000372025 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.359e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RCAN1-214ENST00000620920 2257 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.359e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FIBP-207ENST00000531115 609 ntTSL 212.82□□□□□ -0.369e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 USP3-218ENST00000560202 1681 ntTSL 512.77□□□□□ -0.369e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.379e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NFYC-211ENST00000427410 1379 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.382e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NFKB1-205ENST00000505458 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.459e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 GET4-204ENST00000426056 502 ntTSL 412.09□□□□□ -0.479e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TWNK-202ENST00000370228 3175 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.489e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 USP28-201ENST00000003302 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.529e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.559e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RCAN1-202ENST00000381132 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.559e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 USP3-206ENST00000558157 2439 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.569e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TTC19-205ENST00000470649 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.48□□□□□ -0.579e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NFYC-212ENST00000440226 1717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.582e-10■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 HDDC3-204ENST00000559834 1076 ntTSL 211.3□□□□□ -0.69e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ZNF138-202ENST00000359735 2679 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.649e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 METTL4-201ENST00000319888 3601 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.659e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NFKB1-212ENST00000600343 4010 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.662e-10■■■■□ 24.7
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