Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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