Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.74e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.724e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PARN-215ENST00000569444 783 ntTSL 34.12□□□□□ -1.754e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 LCMT1-208ENST00000573435 196 ntTSL 34.1□□□□□ -1.754e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PRR11-206ENST00000581182 695 ntTSL 34.09□□□□□ -1.754e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 LCMT1-211ENST00000576382 260 ntTSL 33.92□□□□□ -1.784e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 SLC11A2-218ENST00000549193 557 ntTSL 43.87□□□□□ -1.794e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.794e-7■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CALD1-214ENST00000466704 903 ntTSL 33.84□□□□□ -1.794e-6■■■■□ 20.7
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ILF3Q12906 USP53-204ENST00000507906 546 ntTSL 43.67□□□□□ -1.824e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.824e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CHEK2-212ENST00000425190 752 ntTSL 53.51□□□□□ -1.855e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 SEC62-206ENST00000470355 370 ntTSL 33.04□□□□□ -1.924e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CCNT1-203ENST00000550457 351 ntTSL 33□□□□□ -1.934e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PANK3-202ENST00000520504 313 ntTSL 52.73□□□□□ -1.974e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 USP37-209ENST00000478329 486 ntTSL 52.72□□□□□ -1.974e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 TMEM117-205ENST00000550495 576 ntTSL 52.7□□□□□ -1.984e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.054e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 LCMT1-213ENST00000577157 522 ntTSL 32.06□□□□□ -2.084e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 HSPA9-206ENST00000506477 664 ntTSL 216.57■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 HSPA9-209ENST00000507886 551 ntTSL 39.25□□□□□ -0.934e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 SH3D19-212ENST00000604440 555 ntTSL 48.65□□□□□ -1.021e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.114e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.674e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.674e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.574e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.544e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.494e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 ACBD4-205ENST00000585553 2241 ntTSL 217.63■□□□□ 0.414e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 THRA-205ENST00000577288 581 ntTSL 425.29■■□□□ 1.644e-6■■■■□ 20.6
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ILF3Q12906 THRA-210ENST00000585047 574 ntTSL 424.66■■□□□ 1.544e-6■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.344e-6■■■■□ 20.6
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ILF3Q12906 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.181e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.184e-6■■■■□ 20.6
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ILF3Q12906 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.244e-6■■■■□ 20.6
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ILF3Q12906 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.384e-6■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.484e-6■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.516e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 20.6
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ILF3Q12906 ZNF551-204ENST00000601064 1826 ntTSL 1 (best)10.26□□□□□ -0.774e-6■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 ZNF551-201ENST00000282296 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.931e-6■■■■□ 20.6
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ILF3Q12906 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.184e-6■■■■□ 20.6
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ILF3Q12906 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.334e-6■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 AMFR-206ENST00000565445 803 ntTSL 521■□□□□ 0.951e-6■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 AMFR-204ENST00000563664 567 ntTSL 49.8□□□□□ -0.841e-6■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 FIRRE-201ENST00000427391 2926 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 PIK3CB-202ENST00000461451 667 ntTSL 223.82■■□□□ 1.41e-8■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 PIK3CB-210ENST00000483968 721 ntTSL 322.43■■□□□ 1.181e-8■■■■□ 20.6
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ILF3Q12906 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.281e-8■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.341e-8■■■■□ 20.6
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ILF3Q12906 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.333e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.343e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 TMEM123-207ENST00000531103 568 ntTSL 43.98□□□□□ -1.773e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 TMEM123-203ENST00000525577 550 ntTSL 43.29□□□□□ -1.883e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 TMEM123-205ENST00000528969 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.12□□□□□ -1.913e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 TMEM123-206ENST00000529492 549 ntTSL 22.59□□□□□ -1.993e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 TMEM165-208ENST00000511710 731 ntTSL 37.22□□□□□ -1.254e-10■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 TMEM165-202ENST00000502797 639 ntTSL 35.62□□□□□ -1.514e-10■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.36□□□□□ -0.273e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.833e-7■■■■□ 20.6
ILF3Q12906 TIMM50-205ENST00000595527 2274 nt12.23□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 FOXP1-215ENST00000497355 1778 ntTSL 1 (best)7.11□□□□□ -1.278e-11■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.378e-11■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.132e-7■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-7■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 FTX-203ENST00000429124 2597 ntTSL 29.12□□□□□ -0.953e-7■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.494e-6■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.114e-6■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.984e-6■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.784e-6■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.744e-6■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.644e-6■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.534e-6■■■■□ 20.5
ILF3Q12906 PCSK6-208ENST00000559417 1035 ntTSL 518.2■□□□□ 0.54e-6■■■■□ 20.5
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