Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 MGE1YOR232W 687 nt1.76□□□□□ -2.13
USB1Q12208 CUP9YPL177C 921 nt1.76□□□□□ -2.13
USB1Q12208 INO80YGL150C 4470 nt1.76□□□□□ -2.13
USB1Q12208 VPS8YAL002W 3825 nt1.76□□□□□ -2.13
USB1Q12208 UBP16YPL072W 1500 nt1.76□□□□□ -2.13
USB1Q12208 SSY1YDR160W 2559 nt1.75□□□□□ -2.13
USB1Q12208 UBP1YDL122W 2430 nt1.75□□□□□ -2.13
USB1Q12208 TMA7YLR262C-A 195 nt1.75□□□□□ -2.13
USB1Q12208 GYP5YPL249C 2685 nt1.75□□□□□ -2.13
USB1Q12208 BPH1YCR032W 6504 nt1.75□□□□□ -2.13
USB1Q12208 MGA2YIR033W 3342 nt1.75□□□□□ -2.13
USB1Q12208 MYO2YOR326W 4725 nt1.75□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RRP6YOR001W 2202 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 IPT1YDR072C 1584 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 ATC1YDR184C 885 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 CBS2YDR197W 1170 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 EMP24YGL200C 612 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RPL11BYGR085C 525 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 GTR2YGR163W 1026 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 GPX1YKL026C 504 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 ECI1YLR284C 843 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YMR144WYMR144W 1029 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 ICY1YMR195W 384 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RPL11AYPR102C 525 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RRP15YPR143W 753 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YBR277CYBR277C 402 nt1.74□□□□□ -2.13
USB1Q12208 HER1YOR227W 3741 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 SSQ1YLR369W 1974 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YCR108CYCR108C 192 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YDR262WYDR262W 819 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RMD6YEL072W 696 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YGR226CYGR226C 210 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 PCL5YHR071W 690 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RMP1YLR145W 606 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RPS30AYLR287C-A 192 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 YLR379WYLR379W 375 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 PEP12YOR036W 867 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 SPR2YOR214C 711 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 PES4YFR023W 1836 nt1.73□□□□□ -2.13
USB1Q12208 SIR4YDR227W 4077 nt1.72□□□□□ -2.13
USB1Q12208 PDR8YLR266C 2106 nt1.72□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RAD18YCR066W 1464 nt1.72□□□□□ -2.13
USB1Q12208 COX6YHR051W 447 nt1.72□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RLP24YLR009W 600 nt1.72□□□□□ -2.13
USB1Q12208 SPC2YML055W 537 nt1.72□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RPL16BYNL069C 597 nt1.72□□□□□ -2.13
USB1Q12208 ATG9YDL149W 2994 nt1.72□□□□□ -2.13
USB1Q12208 NGG1YDR176W 2109 nt1.72□□□□□ -2.13
USB1Q12208 ESC2YDR363W 1371 nt1.72□□□□□ -2.13
USB1Q12208 RUD3YOR216C 1455 nt1.71□□□□□ -2.14
USB1Q12208 TRL1YJL087C 2484 nt1.71□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.71□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YDL118WYDL118W 381 nt1.71□□□□□ -2.14
USB1Q12208 UBC5YDR059C 447 nt1.71□□□□□ -2.14
USB1Q12208 HTB1YDR224C 396 nt1.71□□□□□ -2.14
USB1Q12208 BTN2YGR142W 1233 nt1.71□□□□□ -2.14
USB1Q12208 PEX34YCL056C 435 nt1.71□□□□□ -2.14
USB1Q12208 SSF1YHR066W 1362 nt1.71□□□□□ -2.14
USB1Q12208 CDC37YDR168W 1521 nt1.71□□□□□ -2.14
USB1Q12208 COX13YGL191W 390 nt1.7□□□□□ -2.14
USB1Q12208 VMA7YGR020C 357 nt1.7□□□□□ -2.14
USB1Q12208 SCH9YHR205W 2475 nt1.7□□□□□ -2.14
USB1Q12208 TPK3YKL166C 1197 nt1.7□□□□□ -2.14
USB1Q12208 SMD3YLR147C 306 nt1.7□□□□□ -2.14
USB1Q12208 UBP2YOR124C 3819 nt1.7□□□□□ -2.14
USB1Q12208 CIN2YPL241C 807 nt1.7□□□□□ -2.14
USB1Q12208 MUD1YBR119W 897 nt1.7□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YBR197CYBR197C 654 nt1.7□□□□□ -2.14
USB1Q12208 MFB1YDR219C 1398 nt1.7□□□□□ -2.14
USB1Q12208 TRZ1YKR079C 2517 nt1.7□□□□□ -2.14
USB1Q12208 GCN2YDR283C 4980 nt1.69□□□□□ -2.14
USB1Q12208 CDC60YPL160W 3273 nt1.69□□□□□ -2.14
USB1Q12208 CST9YLR394W 1449 nt1.69□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YCR099CYCR099C 468 nt1.69□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YCR100CYCR100C 951 nt1.69□□□□□ -2.14
USB1Q12208 NSE4YDL105W 1209 nt1.69□□□□□ -2.14
USB1Q12208 RAV2YDR202C 1056 nt1.69□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YFR057WYFR057W 456 nt1.69□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YIL058WYIL058W 285 nt1.69□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YBR051WYBR051W 351 nt1.69□□□□□ -2.14
USB1Q12208 SLK19YOR195W 2466 nt1.69□□□□□ -2.14
USB1Q12208 SRP1YNL189W 1629 nt1.69□□□□□ -2.14
USB1Q12208 IRC20YLR247C 4671 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 CTF13YMR094W 1437 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 NIC96YFR002W 2520 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 LHS1YKL073W 2646 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YLR198CYLR198C 360 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 GPN3YLR243W 819 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 NEJ1YLR265C 1029 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YML084WYML084W 309 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 SIP18YMR175W 240 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 ARR2YPR200C 393 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 MED8YBR193C 672 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 GDI1YER136W 1356 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 RTT107YHR154W 3213 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 MGM1YOR211C 2646 nt1.68□□□□□ -2.14
USB1Q12208 RRP12YPL012W 3687 nt1.68□□□□□ -2.14
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