Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms