Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHRNB3Q05901 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNB3Q05901 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms