Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms