Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms