Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms