Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms