Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HBBP68871 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HBBP68871 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HBBP68871 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms