Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRP54P61011 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRP54P61011 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRP54P61011 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRP54P61011 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRP54P61011 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRP54P61011 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRP54P61011 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRP54P61011 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRP54P61011 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRP54P61011 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRP54P61011 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRP54P61011 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRP54P61011 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRP54P61011 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRP54P61011 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRP54P61011 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRP54P61011 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRP54P61011 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRP54P61011 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms