Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms