Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms