Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3M2P53677 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms