Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms