Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA1P52294 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms