Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSEN1P49768 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSEN1P49768 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSEN1P49768 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSEN1P49768 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSEN1P49768 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSEN1P49768 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSEN1P49768 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms