Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSNK1EP49674 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms