Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNPDA1P46926 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms