Protein–RNA interactions for Protein: P46108

CRK, Adapter molecule crk, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKP46108 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRKP46108 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRKP46108 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRKP46108 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRKP46108 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRKP46108 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRKP46108 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRKP46108 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRKP46108 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRKP46108 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRKP46108 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRKP46108 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRKP46108 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRKP46108 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRKP46108 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRKP46108 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRKP46108 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRKP46108 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRKP46108 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRKP46108 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRKP46108 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRKP46108 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRKP46108 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRKP46108 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRKP46108 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRKP46108 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRKP46108 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRKP46108 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRKP46108 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRKP46108 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRKP46108 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRKP46108 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRKP46108 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRKP46108 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRKP46108 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRKP46108 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRKP46108 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRKP46108 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRKP46108 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRKP46108 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRKP46108 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms