Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTRLP40313 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTRLP40313 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTRLP40313 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTRLP40313 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTRLP40313 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTRLP40313 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTRLP40313 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTRLP40313 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTRLP40313 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTRLP40313 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTRLP40313 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTRLP40313 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTRLP40313 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTRLP40313 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTRLP40313 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms