Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA4P34932 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA4P34932 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms