Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAP3P28838 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAP3P28838 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LAP3P28838 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LAP3P28838 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAP3P28838 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAP3P28838 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms