Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCM3P25205 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCM3P25205 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCM3P25205 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCM3P25205 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCM3P25205 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCM3P25205 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCM3P25205 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCM3P25205 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms