Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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