Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSRP1P21291 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms