Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL2P19875 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL2P19875 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL2P19875 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL2P19875 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL2P19875 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL2P19875 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL2P19875 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL2P19875 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL2P19875 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL2P19875 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL2P19875 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms