Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms