Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD46P15529 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD46P15529 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD46P15529 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD46P15529 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD46P15529 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD46P15529 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD46P15529 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD46P15529 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD46P15529 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD46P15529 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD46P15529 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD46P15529 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD46P15529 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CD46P15529 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms