Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA1P15085 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA1P15085 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA1P15085 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA1P15085 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA1P15085 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA1P15085 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA1P15085 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA1P15085 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA1P15085 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA1P15085 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA1P15085 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPA1P15085 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPA1P15085 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPA1P15085 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA1P15085 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA1P15085 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA1P15085 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA1P15085 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA1P15085 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA1P15085 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA1P15085 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA1P15085 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA1P15085 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA1P15085 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA1P15085 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA1P15085 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA1P15085 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA1P15085 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA1P15085 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA1P15085 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA1P15085 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA1P15085 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA1P15085 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA1P15085 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA1P15085 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA1P15085 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA1P15085 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA1P15085 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA1P15085 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA1P15085 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA1P15085 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA1P15085 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA1P15085 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms