Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms