Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LYL1P12980 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LYL1P12980 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LYL1P12980 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LYL1P12980 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LYL1P12980 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LYL1P12980 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYL1P12980 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms