Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTAP09496 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTAP09496 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLTAP09496 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLTAP09496 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTAP09496 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTAP09496 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTAP09496 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms