Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGAP02671 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGAP02671 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FGAP02671 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGAP02671 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGAP02671 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGAP02671 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGAP02671 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGAP02671 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms