Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAP4K4O95819 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP4K4O95819 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms